По ссылке разъяснение, не сама инструкция. Сама инструкция с расчетом есть, например, здесь:
https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/411062979/
Ну, похоже, да, считают все проценты по вкладам, не вычитая необлагаемую сумму. Не считают страховые и социальные пенсии, стипендии, другие...